真核包括真菌和動植物,對于沒有參考基因組的真核轉錄組研究,通過進行de novo基因組預測,并對預測所得轉錄本進行功能注釋、SNP、SSR標記開發等分析。揭示其中轉錄活性較高的相關基因及其功能。一般而言,轉錄組具有不同的梯度的實驗設計(如不同溫度,不同添加物濃度等等),所以會有多個轉錄組進行比較分析,從而揭示與研究的功能(表象)具有一定聯系的基因(簇)或代謝途徑(機制)。
無需了解物種的基因或基因組信息,便可直接對任意物種進行最全面的轉錄組分析
可檢測未知基因,發現新的轉錄本
從實驗方案設計到分析報告解讀,提供全方位的售前售后服務
Total RNA
mRNA片段化
cDNA合成
文庫構建
上級測序
動物組織>2g;植物組織>4g;菌體>2ml(密度約106-108 個/ml,對數期或穩定初期,OD600約0.6-0.8),菌液離心除去培養基;血液樣品>2ml。菌體及動物組織可用RNA保護劑(菌體/組織體積:RNAlater=1:5)處理或液氮凍存后保存
濃度≥50ng/μl,總量≥1μg(單次建庫),OD260/280介于1.8~2.2之間,OD260/230≥2.0,RIN值≥6.5,動物28S:18S≥1.0,植物25S:18S≥1.0,菌體23S:18S≥1.0,確保RNA無降解
濃度≥10ng/μl,總量≥2μg(單次建庫),RIN值≥6.5,OD260/280介于1.8~2.2之間
HiSeqPE150
6G~12G
50個工作日