HuMiChip功能基因芯片是針對人類相關微生物設計的,用于檢測人體內(人體相關組織中)微生物群落的功能組成和結構,進而探討人類健康與微生物群落之間的相互關系的高通量宏基因組檢測工具。
該芯片共設計了36,802個探針,涵蓋50,007個蛋白編碼序列并包含139個關鍵的基因家族。當中共有25,003個序列特異性探針,可專一地檢測單個特定的功能(序列)。該芯片已在人體口腔和腸道微生物群落進行了實驗測試,結果表明該芯片能清晰反映正常人群與患有齲齒和牙周炎病人口腔微生物群落與功能結構的差異,從而揭示微生物群落對疾病的響應。
HuMiChip芯片是根據微生物相關的各類功能基因設計的特異性探針,可專一地檢測單個特定的功能(序列)
能檢測到低至0.001%相對豐度的基因家族,并與第二代測序技術的檢測結果相一致
HuMiChip芯片所針對的微生物群落功能十分全面,包括了如氨基酸、碳水化合物、糖、脂類、輔酶、維生素、萜類和聚酮化合物等的代謝與合成相關的微生物
與基于測序的宏基因組數據相比,GeoChip數據簡單易懂,可直接用于各類統計分析,有助于結果的解讀和比較
樣品采集
核酸(DNA/RNA)提取
核酸檢測
熒光標記
芯片雜交
芯片掃描與成像
DNA或cDNA
RNA
60K/180K
60K/180K
55個工作日
65個工作日