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Gut microbes
標題：An integrated workflow for enhanced taxonomic and functional coverage of the mouse fecal metaproteome
譯名：增強小鼠糞便元蛋白組的分類和功能覆蓋的研究
作者：Nicolas Nalpas 等
時間：2021.11.11
影響因子：10.245
DOI：10.1080/19490976.2021.1994836
腸道微生物群通過調節新陳代謝、免疫反應和行為，在形成宿主平衡方面起著關鍵作用。其調節不良與代謝、免疫和神經精神病有關，并伴有細菌代謝調節的變化。雖然蛋白質組學非常適合分析單個微生物，但由于樣本的物理結構、受污染宿主蛋白質的存在和數百種分類的共存，糞便樣本的元蛋白學具有挑戰性。研究評估了以典型質譜為基礎的，應用于小鼠糞便的樣本制備和數據分析策略的元蛋白組學實驗。實驗結果表明，Unipept 軟件在確定來源不明肽的分類注釋中提供了較高的靈敏度和特異性。對匹配的元蛋白組和元基因組數據的比較揭示了蛋白質和基因豐度之間的正相關關系。
推薦語：研究發現，與預期相比，幾乎所有檢測到的蛋白質組其功能和類別在元蛋白組中豐富度不同，這突出了在研究復雜微生物群樣本時進行元蛋白質組學研究的必要性。
Gut microbes
標題：Fusobacterium nucleatum drives a pro-inflammatory intestinal microenvironment through metabolite receptor-dependent modulation of IL-17 expression
譯名：具核梭桿菌通過IL-17表達物的代謝受體依賴調節，驅動有利于炎癥的腸道微環境
作者：Caitlin A Brennan 等
時間：2021.11.15
影響因子：10.245
DOI：10.1080/19490976.2021.1987780
結腸直腸癌 （CRC）相關的微生物結腸疾病會產生腫瘤親和的腸道環境，并在腫瘤微環境中形成免疫反應。研究發現，接種具核梭桿菌株Fn7-1的小鼠規避了防止腸道結腸化的技術障礙，在腫瘤形成前驅動結腸Il17a表達，并增強腸道腫瘤的效力。使用以復雜微生物群移植的腺菌小鼠，研究觀察到腸道Fn7-1的移植增加了結腸Th17細胞頻率及其IL-17A和IL-17F表達，同時增加了結腸Ria Il23p19表達。由于Fn7-1穩定存在于模型腸道中，研究假設微生物代謝物，特別是F.核在培養過程中將產生大量短鏈脂肪酸（SCFA)，如實驗所證明的，在腸道中這可能會調解其免疫調節作用。
推薦語：研究表明，具核梭桿菌通過以FFAR2依賴的方式塑造Th17反應來影響腸道免疫力，并有可能減緩同位素介導CRC。
Ecotoxicology and environmental safety
標題：Characterization of gut microbiota, metabolism and cytokines in benzene-induced hematopoietic damage
譯名：苯引起的造血損傷中腸道微生物群、代謝和細胞因子的特征
作者：Zhang Lei 等
時間：2021.11.12
影響因子：6.291
DOI：10.1016/j.ecoenv.2021.112956
苯暴露導致造血功能障礙，腸道微生物群紊亂可誘發宿主代謝、免疫障礙和疾病發病。本研究中，微生物學、代謝學和細胞因子網絡被應用以找出參與苯誘導造血毒性的小鼠腸道微生物群、代謝和細胞因子的關鍵特征。高通量測序結果表明，苯暴露擾亂了小鼠腸道微生物群、代謝和細胞因子的平衡。研究發現IL-5在苯暴露組以依賴劑量的方式顯著增加，并且IL-5和造血損傷之間有顯著的負相關性，且存在6種細菌、12種血漿代謝物和6種細胞因子與苯引起的造血損傷有關。
推薦語：研究發現，腸道微生物群的植物結構改變會影響代謝表型，而代謝表型是腸道微生物的信使，影響宿主炎癥。這項初步研究為研究苯誘發造血毒性的潛在機制提供了新的見解。
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